Ни какого герметика не нужно. Я бы сделал такой вариант. И внизу должна быть свобода для движения. И по ширине не надо делать впритык. Хотя, лучше бы Вы делали эту крышу в плюсе, не по нынешним морозам. ПСУЛ в фальцы и по краям ендовы(выделено синим).
Извините,хочу спросить; тот загиб на рисунке, за который кляммер зацеплен - это противокаппилярный фалец?